Если после прививки против гриппа происходит заражение, то организм создает иммунный ответ, который не дает заболеть. Но давление со стороны иммунной системы может спровоцировать мутацию вируса, и он может быть заразным.
Новое исследование в Массачусетском технологическом институте раскрывает механизм этого антигенного дрейфа. Ученые проанализировали сеть аминокислот, входящих в состав вирусного белка гемагглютинина, и определили те, которые наиболее часто подвергаются мутации.
Ежегодно создаваемые вакцины стимулирует выработку антител, предназначенных для гемагглютинина (ГГ). Но при встрече с антителами вирус способен меняться и распространяться далее. Новые штаммы связаны с рецепторами на поверхности клеток дыхательных путей. Ученых озадачило то, что обнаруженное место мутации находилось далеко от целевого рецептора ГГ.
Белки состоят из длинной цепочки аминокислот, а реакции определяются взаимодействиями между аминокислотами. Ученые провели анализ, чтобы изучить взаимодействия аминокислот и влияние на белок, что зависит от электрических зарядов и других свойств атомов. Оказалось, что аминокислоты в антигенном секторе были тесно связанными, что повышало шансы на мутации. Слабые связи не влияли на изменение генов рецепторов.
Исследование открывает инновационный подход к пониманию того, как вирусные белки эволюционируют в ответ на реакции иммунитета. Имея возможность выявления аминокислот, обеспечивающих переход вируса к наиболее заразной форме, ученым удастся создать вакцины, которые не вызывают указанные изменения.