Создан новый универсальный алгоритм анализа крови

Ученые из Медицинской школы университета Стэнфорда разработали алгоритм программного обеспечения, позволяющий разделить образец крови на различные типы клеток и обнаружить важные изменения активности гена для каждого из них.

В исследовании они точно определили клетки, указывающие на вероятность отторжения почек при пересадке. «Рисунок крови является одним из основных диагностических тестов в клинической практике», — говорит один из исследователей Атул Бьют — «Мы собирались использовать микрочипы, чтобы найти изменения в крови, которые указывают отклонения в любой части организма. Но отличие одного типа клетки от другого является важной частью этого». Работа над изобретением началась еще 15 лет назад. Микрочипы — искусственная сетка, на поверхности которой расположены десятки тысяч датчиков, различающих последовательности нуклеиновых кислот. Чип передает флуоресцентный сигнал, записывающий последовательность из конкретного образца крови. Существующие способы разделения крови на ее составляющие являются трудоемкими и дорогостоящими. Но ученые разработали алгоритм, состоящий из множества простых уравнений. Одновременное их решение позволит изучить генетическое изменение каждого типа клеток. Для проверки алгоритма они взяли 24 образца крови у детей, перенесших пересадку почек. У 15 из пациентов были признаки отторжения органа. Новый алгоритм позволил найти сотни отклонений в работе генов. Они указали на успех или неудачу в проведенной операции по пересадке. К тому же все выводы ученые сделали, исследуя лишь моноциты.