Геномный анализ улучшит диагностику рака

Ученые из медицинской школы Джона Хопкинса проанализировали геном пациентов с раком, чтобы создать индивидуальные анализы крови, которые помогут выбрать лучший вариант лечения. Генетические анализы крови смогут контролировать состояние опухоли после терапии и определить рецидив рака.

«Используя этот подход, мы можем создать биомаркеры для любого больного раком», — говорит Виктор Велчулеску, профессор в области онкологии. «В прошлом анализе генома мы работали с однобуквенными изменениями, но в этом исследовании, мы меняли местами секции генома опухоли», — говорит Берт Вогельштайн, соруководитель Института Людвига. — «Эти изменения, как содержание книжных глав, их легче идентифицировать и обнаружить в крови». Такие перестановки ДНК встречаются исключительно в раковых клетках, потому являются идеальными биомаркерами для рака. Используя шесть наборов образцов тканей колоректального рака и рака молочной железы, ученые применяли методы определения последовательности белков, чтобы составить каталог для каждого пациента. Чтобы найти перестановки ДНК, они сперва нашли области, где количество копий ДНК было больше или меньше ожидаемого, и где секции различных хромосом сливались. Они проанализировали указанные области, чтобы определить ориентацию или интервал изменений. От четырех до пятнадцати перестановок было найдено в каждом из образцов. Затем ученые нашли подобные изменения в образцах крови пациентов. «Мы разработали биомаркер, который мог оценить перестановку, и применили анализ крови, чтобы оценить его, поскольку пациент проходил множественное лечение рака», — заявили ученые. После удаления опухолей начальные уровни биомаркеров падали, но затем повышались вновь, что указывало на наличие остатков раковых клеток. После химиотерапии и второй операции уровни биомаркеров соответствовали небольшим очагам метастазов. По словам исследователей, такие тесты определят присутствие злокачественных клеток в хирургических надрезах и тканях лимфатического узла, что важно для того, чтобы диагностировать болезнь на ранней стадии. Они смогут обнаружить рак до того, как он будет найден во время компьютерной томографии.