Масштабный анализ ДНК отклонения хронического лимфолейкоза (ХЛЛ) обнаружил несколько новых генов, которые управляют этой распространенной формой рака крови. Ученые из института рака Дана-Фарбер смогут предсказать будущий характер развития болезни.
Используя мощное секвенирование ДНК, ученые изучали гены 91 пациента. Мутации в одном из новых генов SF3B1 регулируют редактирование сообщений РНК, которые формируют генетический шаблон клетки для создания белков . «Мы определили новые пути рака — аберрантный сплайсинг РНК — который был недооценен ранее», — говорят ученые.
ХЛЛ отличается тем, что заболевание ведет себя по-разному у каждого пациента. У половины пациентов болезнь развивается агрессивно, но может быть ленивой, когда симптомы усиливаются на протяжении десятилетий.
До этого исследования врачи обладали ограниченным набором маркеров, чтобы предсказать ход развития ХЛЛ. Теперь ученые последовательности всего генома трех пациентов, и только генов, кодирующих белок ExoME у 88 пациентов.
Поиск выявил девять генов, которые часто мутировали при ХЛЛ образцы и влияли на пять путей, регулирующих ремонт поврежденных ДНК, клеточный цикл, сигнализациию Notch, воспаление, РНК сплайсинг. Два ранее были известны и связаны с ХЛЛ и раком в целом. Еще две мутации — MyD88 и NOTCH1 — были связаны с лейкемией, что подтверждено в этом году. Остальные пять выявлены впервые: SF3B1, FBXW7, DDX3X, MAPK1 и ZMYM3.
Ген SF3B1 изменялся наиболее часто (в 14 образцах из 91). Он состоит из фактора сращивания 3b и белка «сплайсосома» — эти молекулы регулируют сплайсинг посторонних молекул РНК (интронов), чтобы создать сообщения РНК (экзоновы) или молекулярный состав, из которого клетка производит белки для тела. Ген SF3B1 часто сопутствует хромосомной аномалии, связанной с более агрессивной формой ХЛЛ.
Но даже независимо от наличия хромосомных отклонений, измененный ген SF3B1 сам по себе был сигналом для агрессивного развития болезни. Пациенты с данной версией гена нуждаются в альтернативных методах химиотерапии, а также в раннем использовании трансплантации стволовых клеток для подавления болезни.
Написать нам